Cinchonankuoren koe
Kääntäjän työstä tuli lopulta hänen kohtalonsa. Kun hän käänsi ”Tutkimuksen Materia Medicasta” englanniksi vuonna 1790, hän epäili cinchonankuoren vaikutuksen oikeellisuutta sovelluksessa malaria. Hän suoritti ensimmäisen huumekokeen, joka on mennyt historiaan cinchonankuoren oikeudenkäynninä.
Hahnemann havaitsi patologisen ehto itsessään toistuvissa testeissä, jotka näyttivät olevan samanlaisia kuin vuorottelu kuume (malaria). Seuraavina vuosina Hahnemann testasi muita lääkkeitä ja pääsi samoihin havaintoihin kuin cinchonankuoren kokeessa. Vuosien varrella hän kehitti niin kutsutun "samankaltaisuussäännön" periaatteeksi sopivan lääkkeen oikeaan valintaan.
Hahnemann julkaisi ensimmäisen kerran ”Hufeland Journal” -lehdessä vuonna 1796, joten tätä vuotta pidetään tämän vuoden syntymävuotena homeopatia. Vuosien mittaan Hahnemann kirjoitti muistiinpanonsa ja vuonna 1810 julkaistiin "Organon der rationellen Heilkunde". Se on nerokkaan yksinäisen uudistus, jonka tarkoituksena on löytää parempia tapoja hoitaa ja parantaa sairaita ihmisiä.
Organon on homeopatia, jonka ydinosa esiintyy tässä kokonaisuudessaan ensimmäistä kertaa: Simila similibus curentur = Samankaltaisia asioita voidaan parantaa samanlaisilla asioilla. Termi homeopatia näkyy myös täällä ensimmäistä kertaa. Hahnemann antoi myös edelleen voimassa olevat ohjeet tartuntatautien desinfioinnista, kotipuhtaudesta, ravitsemuksesta, lastenhoidosta ja koulutuksesta.
Hän ilmaisi yllättäviä näkemyksiä kolera. Hän katsoi sen kauan ennen bakteriologista aikakautta "pienimmille eläville olennoille", jotka välittivät ihmiseltä toiselle. Apteekkina ja kemikaalina hän kirjoitti myös Apotheker-Lexikonin.
Vuosikymmenien ajan se oli paljon kysytty ja käytetty esine. Hahnemann kuoli vuonna 1843 88-vuotiaana Pariisissa ja työskenteli lääkärinä kuolemaansa saakka.
